Dotaz bohužel nedává přesnou představu o situaci.
Každá smlouva, a tedy i dodatek (řečí občanského zákoníku jde o „změnu smlouvy“) jsou platné od uzavření až do svého ukončení anebo do případného zrušení podle § 7 odst. 1 ZRS, poté, kdy nebyla do 3 měsíců řádně v registru zveřejněna.
Zároveň lze smlouvu i po ukončení její platnosti „opět oživit“ tím, že se pozdějším dodatkem její platnost, resp. lhůta k plnění závazku prodlouží (srov. vložený odkaz).
Otázka účinnosti má jinou povahu - smlouva je účinná až okamžikem zveřejnění v registru smluv. Z vámi popsané souslednosti událostí však nelze nic dovodit, bez znalosti obsahu uvedených dodatků a bez znalosti, zda v mezidobí mezi uplynutím původní doby platnosti smlouvy a účinností dodatku, který (asi) její platnost prodloužil, došlo k nějakému plnění, jež by v tu dobu mohlo představovat plnění bez právního důvodu, které by (teoreticky) mělo být následně vypořádáno. Pokud však k takové situaci došlo pouze po několik dnů těsně předcházejících zveřejnění dodatku (a tedy obnovení platnosti smlouvy), vykládá se taková situace v rovině soukromého práva tak, že účinky smlouvy, jež nabyla účinnosti zveřejněním, do (či pod) sebe vtahují i závazky realizované krátce před tímto nabytím účinnosti.
Pro podrobnější posouzení je nutno znát smlouvy a faktické události a přesahuje tak již funkci této poradny, šlo by o samostatnou konzultaci.